蛋白质纯度判断

经过针对目标蛋白的分离后，普遍面临的问题有三个：蛋白质纯度鉴定、蛋白质是单体还是复合体的判断、蛋白质天然或个别亚基分子量的测定。答案来自于对实验程序数据的综合分析：通常的策略是单向(one dimensional，1D)或双向(two dimensional，2D)电泳，和常规凝胶过滤或HPLC凝胶过滤。

如果一个蛋白质是单体或者是含有相同亚基的复合体，那么在单向SDS变性电泳后(1D SDS-polyacrylamide gel electrophoresis)如果检测到一个单。条带或者双向(2D)电泳后检测到一个圆点就说明这个蛋白得到了纯化。如果一个蛋白是含不同亚基复合体，它的纯度可以用非变性电泳(non-denaturing electrophoresis)后看到单的条带来决定。

杂质蛋白质低于5％(最好是低于2％)是一个蛋白质提纯的标志，它的天然分子量可以用常规凝胶过滤或HPLC凝胶过滤方法来估算：比较它的洗脱体积与一群已知分子量的对照蛋白质的洗脱体积。每一个亚基的分子量则可以用变性聚丙烯酰胺电泳来测定；每个亚基的数量可以通过比较天然分子量和每个亚基在变性条件下的分子量推算获得。

来源：北京标准物质网 www.biaowu.com        
        
来源：中国微生物菌种网 www.bnbio.com